Motto: „ Întreaga artă a instruirii constă în capacitatea de a trezi curiozitatea naturală a minților tinere cu
scopul de a-și satisface această curiozitate ulterior”.
În anul 1990, Secția de învățământ din or. Cahul a emis ideea de a înființa în oraș un liceu care ar fi capabil să satisfacă noile condiții educaționale.
La 28 august 1990 a fost emis ordinul nr. 129 al Șefului Secției orășenești de învățământ V. Bejenaru, ordin conform căruia a fost sistată activitatea Școlii-internat, constituind în incinta ei un liceu teoretic.
Inaugurarea liceului a avut loc pe data de 15 septembrie 1990, iar Constantin Reabțov , profesor de limba și literatura română, a propus ca noii instituții să i se confere numele domnitorului Ioan Vodă. Astfel, conform deciziei nr 2/3 din 23 ianuarie 1991 a Prezidiului Consiliului orășenesc de deputați ai poporului, liceului i-a fost conferit numele „Ioan Vodă”.
Director al Liceului a fost desemnat d-ul Chiciuc Constantin care de atunci se află la cârma instituției știind să-și trăiască fără exaltare succesele sale și să-și depășească decepțiile întâlnite în toți acești ani cu mult curaj, tenacitate, perseverență, modestie și devotament.
Anul de învățământ 2000/2001 a fost semnificativ în mai multe privințe:
A fost inaugurat ciclul de învățământ primar și gimnazial;
Grație relațiilor de colaborare cu Agenția Universitară a Francofoniei și cu Alianța Franceză, Liceul „Ioan Vodă” a fost inclus într-un program special- cel de constituire a claselor bilingve( studierea aprofundată a limbii franceze ce constituie și limba de predare a unor discipline de profil real);
Pe data de 20 noiembrie a fost de semnată „Ziua autoconducerii”, unde toate lecțiile din ciclul gimnazial și liceal erau conduse de elevii din clasele a IX-XII.
A fost reluată editarea ziarului liceului intitulat : „Crai- nou”, prin implementarea proiectului Operația Crai- nou, obținut în cadrul Programului de granturi mici asistat de CIDDC.
Liceul Teoretic „ Ioan Vodă” este o instituție de învățământ preuniversitară de stat, care asigură elevilor o pregătire teoretică fundamentală . El este înființat cu scopul de a creea condiții optime de instruire a elevilor, în vederea asigurării procesului de integrare în sistemul educațional ce prevede studierea aprofundată a tuturor disciplinilor. Prin îmbinarea echilibrată a tradiției cu inovația și continuitatea consecvent ascendentă, Liceul Teoretic„ Ioan Vodă” are ca și obiectiv formarea unei personalități creative orientate spre succes și atașată valorilor perene naționale și universale.